以埔里及鄰近地區命名的蝴蝶就有埔里黃紋弄蝶、埔里紅弄蝶、埔里紫小灰蝶、埔里波紋小灰蝶、埔里琉璃小灰蝶、埔里三線蝶、眉溪小灰蝶、霧社星褐弄蝶、霧社紫小灰蝶、霧社綠小灰蝶、霧社烏小灰蝶、霧社燕小灰蝶、霧社黑燕小灰蝶、萬大星褐弄蝶、仁愛綠蛺蝶、奇萊褐弄蝶、國姓小紫蛺蝶等17種。

另外，清金綠小灰蝶（Chrysozephyrus yuchingkinus）更是為了紀念木生昆蟲博物館創始人余清金長期在蝴蝶產業及調查研究上的奉獻，而以其姓名為種小名的蝴蝶。